20世界90年代以后，医生们发现利巴韦林与干扰素联合治疗能明显提高干扰素对慢性丙型肝炎的疗效，提高了病毒的完全应答率和持续病毒学应答率，减少了治疗后的复发率。干扰素联合利巴韦林治疗后，丙型肝炎的持续病毒学应答率从19%-25%提高到30%-40%。丙型肝炎的治疗从此进入干扰素联合利巴韦林治疗时代。
为了改变干扰素半衰期短，需要频繁注射的状况，科学家们开始研究“长效干扰素”。2000年以后，长效干扰素-聚乙二醇化干扰素获批。聚乙二醇干扰素不仅减少了患者的注射次数，而且提高了疗效。与利巴韦林联合治疗，使治疗后持续病毒学应答率增加到40%-60%。从此，聚乙二醇化干扰素联合利巴韦林成为当时丙型肝炎的标准治疗方法。
干扰素的发现是慢性丙型肝炎治疗的一个重要的里程碑。但是，干扰素与利巴韦林联合治疗还存在许多的问题，一是基因1型，尤其是1b型丙肝病毒感染者对干扰素联合利巴韦林的应答较差，其完全应答率往往不到40%，被称为是难治型丙型肝炎。
二是干扰素的副作用比较明显，相当一部分患者不能耐受其副作用，还有30%-60%的丙型肝炎患者，尤其是失代偿期肝硬化患者，存在干扰素治疗的禁忌症。
近年来，在科学家们的努力下，丙肝病毒复制之谜逐渐的被揭开，一些具有直接抗病毒作用的口服药物先后获批上市，丙型肝炎的治疗进入了直接抗病毒时代。
在2011年，两种具有直接抗病毒作用的蛋白酶抑制剂博赛普韦和特拉普韦先后上市，博赛普韦或特拉普韦与聚乙二醇干扰素和利巴韦林联合的三联疗法可以使基因1型丙肝病毒感染的持续病毒学应答率提高到60%以上。
2013年，索非布韦和西米普韦获批上市，这两种药物不仅把慢病丙型肝炎治疗后的持续病毒学应答率提高到90%以上，而且终于实现了丙肝“无干扰素治疗”的梦想，称为慢性丙型肝炎治疗的又一个重要的里程碑。
2014年以来，达拉他韦、阿舒瑞韦等更多的直接抗病毒新药和它们的“鸡尾酒”复方制剂先后上市，不仅使丙肝的治疗彻底摆脱了副作用较大的干扰素，缩短了疗程，而且使丙肝的治愈率提高到95%以上。丙肝病毒感染者终于有了更加安全、有效、方便和短疗程的治疗方法。
丙肝已经成为一种完全可以治愈的疾病了!人们预测，将来人类很有可能在全球完全消除慢性丙肝病毒感染。
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