肝硬化患者容易发生十二指肠球部溃疡、幽门溃疡、复合型溃疡、胆汁返流等，胃镜较X线检查诊断准确率高，并可以结合临床医生提供合理选用抗溃疡药和胃粘膜保护剂的依据。
慢性肝炎患者由于肝脏的门静脉系统淤血，胃粘膜也经常淤血、缺氧，又因为肝功能障碍，体内有毒物质不能完全被肝脏清除，同时，机体内分泌紊乱等均可导致胃溃疡等损坏。胃镜检查有助于此类疾病的病因诊断。
急性肝炎急性期，胃十二指肠黏膜损伤发生率很高，是引起患者恶心呕吐、食欲缺乏等临床症状的重要原因，可以用胃镜检查来诊断。
胃镜检查有一些禁忌症，比如患者有严重的心肺疾病、咽部的炎症、降主动脉瘤、食管狭窄、坏死性食管炎、急性蜂窝织炎等，出现肝性脑病等严重的并发症等也属于禁忌症。少数患者会有精神过度紧张，有抗拒心理，不合作的，也是不能做胃镜检查的。
胃镜检查一般情况下是安全的。只是在检查过程中和检查后，可能会出现咽部不适或者是轻度疼痛等症状，大多数的患者都能耐受。极少数情况下会出现食管或胃穿孔，出血等一些少见的并发症，这时候往往是需要进行外科的处理的。
另外我们说一下腹腔镜检查，腹腔镜检查是从腹部手术切口进入的，能直接对部分肝脏的整体和表面的情况进行肉眼的观察和摄像，同时可以有针对性地定位穿刺获得肝组织标本，不过前者更为可靠。腹腔镜不仅能直接观察肝脏变化，同时可以进行有目的性的定位穿刺，比体表的盲目穿刺准确的多，特别是对于非弥漫性肝病腹腔镜检查更准确。
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